北京市生态环境保护科学研究院（以下简称北京市环科院）是全国第一家从事环境保护的科研机构。其前身是1957年成立的建工部市政研究所，1973年改名为北京市环境保护科学研究所，1994年改为北京市环境保护科学研究院，2021年9月10日正式改为北京市生态环境保护科学研究院。

北京市环科院现有职工300余人，其中，研究员及教授级高级工程师17人、副研究员及高级工程师74人、先后享受国务院政府津贴20人次，获国家级、市级突出贡献专家10人次。作为我国首批有权授予环境工程硕士学位的单位，历年来北京市环科院已培养硕士研究生140余人。2013年经批准设立博士后科研工作站。

北京市环科院下设：城市生态环境研究所、环境规划与政策研究所、大气环境与污染防治研究所、水生态环境研究所、土壤环境与污染场地修复研究所、固体废物污染防治研究所、污染源研究中心、环境分析测试中心、环境工程技术研究中心、环境技术咨询所、绿色发展与智慧环保技术中心等专业部门。

以北京市环科院为依托单位的工程中心有：国家城市环境污染控制工程技术研究中心（科学技术部）、生态环境部工业废水污染控制工程技术（北京）中心；北京市重点实验室有：污染场地风险模拟与修复北京市重点实验室、城市大气挥发性有机物污染防治技术与应用北京市重点实验室、城市环境污染控制技术研发北京国际科技合作基地。

北京市环科院具有国家发改委颁发的生态建设和环境工程咨询单位甲级资信证书。北京市发改委颁发的市政公用工程乙级资信证书。

经过在我国环保战线近60年的积累与发展，北京市环科院在政策法规制定、污染防治技术研发与设计、生态工程建设、区域环评规划、成果转化与产品开发等方面均取得了丰硕的成果。其中，获得国家级各种科技奖励20余项，获省（部）级科技奖励170余项，取得专利、软件著作权200余项，并且多次在北京市科研院所“改革与发展”考评中获得一、二等奖励。

多年来，北京市环科院承担并完成了大量环境治理与管理急需的科研项目，开发出多种实用化技术，为改善首都环境质量，为环境管理决策提供了重要的技术支持与服务。迄今为止，北京市环科院累计完成环境影响评价3800余项，各类环境科学与环境技术方面的研究项目近2000项，在全国近30个省（市）自治区完成治理工程1800余项。